При изучении сапфиров внутренние включения могут помочь отличить природный сапфир от синтетического аналога. Синтетические аналоги обычно лишены или имеют темную шихту или беловатые вуалевидные включения, которые являются результатом процесса кристаллообразования в специальных контейнерах.
В природных сапфирах часто можно обнаружить различные минеральные включения из окружающих пород, такие как иголочки рутила. Эти рутиловые включения отвечают за характерный шелковистый эффект в камне, и иногда при расположении под определенным углом могут создавать оптический эффект, называемый "астеризм", что проявляется в виде звездчатого отражения света.